Ο γαλαξίας πλήττεται από τον Πόλεμο των Κλώνων, έναν Εμφύλιο Πόλεμο μεταξύ του στρατού των ανδροειδών, των μοχθηρών Αυτονομιστών, κατά της Γαλαξιακής Δημοκρατίας και των Τζεντάι υπερασπιστών της. Για να αποκτήσουν πλεονέκτημα στην κλιμακούμενη διαμάχη, ο Τζεντάι Άνακιν Σκαϊγουόκερ και η μαθήτρια του, Ασόκα Τάνο, αναλαμβάνουν να φέρουν σε πέρας μια αποστολή με απροσδόκητες συνέπειες που θα τους φέρει αντιμέτωπους με τον διαβόητο άρχοντα του εγκλήματος Τζάμπα Δε Χατ. Και σαν να μην έφταναν οι κίνδυνοι που τους περιμένουν στον Τατούιν, ο Άνακιν και η Ασόκα πρέπει να αντιμετωπίσουν και τους σατανικούς πράκτορες του Κόμη Ντούκου που τους καταδιώκουν - μεταξύ των οποίων και τον μυστηριώδη Ασάζ Βέντρες - οι οποίοι δε θα σταματήσουν πουθενά, προκειμένου να κατατροπώσουν τους Τζεντάι. Στο μεταξύ, στο μέτωπο, ο Όμπι-Ουάν Κενόμπι και ο Μάστερ Γιόντα ηγούνται του στρατού των κλώνων σε μια ιπποτική προσπάθεια να αναχαιτίσουν τις δυνάμεις της Σκοτεινής Πλευράς.

Η νέα περιπέτεια ενός γαλαξία πολύ πολύ μακρινού, έρχεται στην μεγάλη οθόνη με την υπογραφή της "Lucasfilm Animation" και η οποία συνδυάζει την θρυλική περιπέτεια του παιχνιδιού "Star Wars Saga" (Ο Πόλεμος των άστρων - Το έπος) με ένα όμορφα δοσμένο γραφικό περιβάλλον. Βασικά στην ταινία βλέπουμε την αιώνια μάχη μεταξύ του καλου και του κακού με τους γνωστούς και πολυαγαπημένους ήρωες απο τις ταινίες του "Πόλεμου των άστρων" όπως είναι ο Άνακιν Σκάϊγουόκερ, o Όμπι-Βαν Κενόμπι, o Γιόντα και η Παντμέ Αμιντάλα, ενώ έχουμε και αρκετούς νέους χαρακτήρες όπως η Ασόκα που είναι η μαθητευόμενη του Άνακιν, η Σίνιστερ, αλλά και οι "κακοί" Κάουντ Ντούκου και Τζένεραλ Γκρίεβους. Η απειλή είναι μεγάλη και το μέλλον του σύμπαντος του "Πόλεμου των Άστρων" βρίσκεται στα χέρια των τολμηρών Ιπποτών Τζεντάι. Η ιστορία μας οδηγεί σε νέες επικές μάχες και σε πραγματικά μεγάλες αποκαλύψεις.